Instalando o pcsx2 no Debian 9.5 64bits 

Siga essas etapas:

1. Incluir os repositórios contrib e non-free em sua source.list; além de acrescentar stretch-backports.

deb http://deb.debian.org/debian/ stretch main contrib non-free
deb-src http://deb.debian.org/debian/ stretch main contrib non-free

deb http://security.debian.org/debian-security stretch/updates main contrib non-free
deb-src http://security.debian.org/debian-security stretch/updates main contrib non-free

# stretch-updates, previously known as 'volatile'
deb http://deb.debian.org/debian/ stretch-updates main contrib non-free
deb-src http://deb.debian.org/debian/ stretch-updates main contrib non-free

deb http://ftp.debian.org/debian stretch-backports main contrib non-free

2. Habilitar Multiarquitetura:

sudo dpkg --add-architecture i386
sudo apt update
sudo apt upgrade

3. Instalar o PCSX2

sudo apt install -t stretch-backports pcsx2

5. Descarregar o pacote contendo as Bios do Playsation 2 na página – Playstation 2 BIOS Pack; Descompactar o arquivo e mover o conteúdo da pasta “bios” para a do emulador.

sudo apt install p7zip-full 
7z x ./Playstation-2-Bios-Pack.7z
mv bios ~/.config/PCSX2/

Agora é só inciar o emulador e seguir configurando. Recomendo buscar por configurações específicas para determinados jogos que podem rodar de modo não esperado.